Le Centre de Recherche en Biotechnologie contient plusieurs laboratoires et plateformes technologiques, organisés selon leurs périmètres techniques:

- Laboratoire de "Détection des OGM"
- Laboratoire de "Biochimie"
- Laboratoire d'"Électrophorèse"
- Laboratoire de "Biologie moléculaire"
- Laboratoire de "Qualité-Analyse"
- Laboratoire d'"Analyses environnementales"
- Laboratoire de "Synthèse et caractérisation moléculaire et macromoléculaire"
- Laboratoire de "Mycologie"
- Laboratoire de "Bactériologie et virologie"
- Laboratoire d'"Analyses agroalimentaires"
- Laboratoire de "Culture in-vitro végétale"
- Laboratoire de "Culture cellulaire"
- Laboratoire de "Biotechnologies animales"
- Laboratoire de "Bioremédiation et écotoxicologie"
- Laboratoire d'"Immunologie"
- Plateforme de "Microscopie et diagnostic génétique"
- Plateforme de "Génomique"
- Plateforme de "Protéomique"
- Unité de "Bioinformatique"